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Un sous-répertoire est en fait un répertoire. On utilise le terme sous-répertoire pour insister sur l'aspect relatif.

Par exemple, sur un système Windows, on ne dira jamais « le sous-répertoire c:\windows\system32 » car c'est un chemin absolu (voir Répertoire), mais on dira plutôt « le sous-répertoire system32 » relativement au répertoire c:\windows.

Le terme répertoire est par contre utilisable dans toutes les situations. On peut très bien dire « le répertoire system32 se trouvant dans c:\windows ».

Notez que l'usage des termes « dossier » et « sous-dossier » est respectivement équivalent à celui de « répertoire » et « sous-répertoire » à une subtilité près : voir Répertoire.

 
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La source est wikipedia http://fr.wikipedia.org/wiki/sous-répertoire